試劑盒應(yīng)用
本試劑盒主要用于細(xì)菌16S rDNA 的快速檢測,無需經(jīng)過繁瑣的基因組DNA 提取純化,取樣后直接
PCR 擴(kuò)增即可獲得16S rDNA 信息,通過比對16S 片段序列,最終獲得細(xì)菌種屬信息。
本試劑盒可以檢測量低至104 個(gè)/mL 個(gè)細(xì)菌,對難培養(yǎng)、珍貴樣本、表型不能鑒定的未知細(xì)菌快速擴(kuò)
增尤為方便。使用本試劑盒前無需提取純化,可直接對菌斑、甘油菌或?qū)?shù)生長期菌進(jìn)行檢測,從
而大大縮短了檢測時(shí)間。試劑盒中提供的16S PCR Premix 已包含有染料,PCR 結(jié)束后直接進(jìn)行瓊脂
糖凝膠電泳,PCR 產(chǎn)物可直接進(jìn)行測序分析。
本產(chǎn)品僅供研究使用,不可用于臨床、食品、化妝品等領(lǐng)域。
保存條件
-20oC 保存。使用時(shí)請置于冰上。
使用方法
1、樣本準(zhǔn)備:
1)菌液:取對數(shù)生長期菌液1-3 μL 加入PCR 反應(yīng)體系中。
2)甘油菌:取1μL 菌液加入PCR 反應(yīng)體系中。
3)單菌落:無菌吸頭或者無菌牙簽挑取單個(gè)菌落置于500 μL 無菌生理鹽水中,渦旋混合均勻,取
1-3 μL 加入PCR 反應(yīng)體系中。
2、推薦PCR 反應(yīng)體系
3、按照以下方法設(shè)定PCR 反應(yīng)
4、瓊脂糖凝膠電泳
使用1%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳,不同菌株電泳片段稍微差別,一般為1.5kb 左右。
5、PCR 產(chǎn)物回收和測序
使用切膠回收試劑盒進(jìn)行回收,并使用以下推薦引物進(jìn)行測序。將DNA 測序結(jié)果與NCBI 數(shù)據(jù)
庫進(jìn)行比對,確定細(xì)菌種類。
注意事項(xiàng)
1、超凈臺(tái)中操作,應(yīng)佩戴無菌手套,穿實(shí)驗(yàn)服,操作前用75%乙醇對實(shí)驗(yàn)器具進(jìn)行消毒。
2、使用無菌移液吸頭和離心管,開蓋務(wù)必輕柔,減少氣溶膠污染。
3、盡可能使用2 次純化細(xì)菌,以提高測序有效率。